질량 분석법은 두 가지 주요 질문에 대한 답을 제공합니다: “내 시료에 무엇이 있는가?” 그리고 “내 시료에 얼마나 있는가?”입니다. 필요한 선택성와 감도에 따라 다양한 유형의 LC/MS 시스템이 필요할 수 있습니다.
거의 모든 LC/MS 이온화원은 중성 분자에 하전된 종을 첨가하는 원리로 작동합니다. 이러한 형태의 이온화는 분자 자체가 전자를 잃지 않는다는 점에서 GC/MS와 다릅니다. 대신 부가물을 얻을 수 있는데, 일반적으로 양이온의 경우 H+ 양성자를 얻거나, 음이온의 경우 양성자를 잃을 수 있습니다. 따라서 LC/MS는 시료 분석물을 분해하지 않고 이온을 생성할 수 있어 분석물의 온전한 질량을 검출할 수 있습니다. 이 프로세스를 소프트 이온화라고도 합니다.
분석물의 극성과 분자량에 따라 이온화원이 결정됩니다. 전자 분무 이온화(ESI)는 다중 전하를 띤 시료(예를 들어 단백질, 펩타이드, 올리고뉴클레오타이드)를 분석하는 데 유용합니다. 단일 전하를 띤 시료(저분자 약물, 농약, 대사체) 또한 분석할 수 있습니다. 대기압 화학 이온화(APCI)는 중간 분자량을 가진 다양한 극성 및 비극성 분석물에 적용 가능합니다.