최근 발생한 팬데믹으로 인해 전염병에 대한 관심과 더불어 다수의 미생물 및 병원체를 식별하고 이해해야 할 필요성이 세계적인 주목을 받아 왔습니다.
아군과 적군
현미경을 통해 처음으로 미생물을 식별했던 17세기 이후로, 우리는 미생물들이 물리적 환경 및 생물의 조절에 얼마나 이롭게 그리고 해롭게 관여하는지 알게 되었습니다.
전통적인 배양, 그리고 보다 최신 기술인 메타지노믹스 기반 기술 등 미생물을 검출할 수 있는 많은 분석법들이 있습니다. 그러나 현재까지 그 어느 분석법도 그렇게 빠르고, 쉽고, 경제적으로 광범위한 미생물에 대한 대규모의 시료를 스크리닝할 수 없었습니다.
수천 개의 바이러스와 병원성 미생물을 스크리닝하는 능력
펜실베니아 대학교 페럴만 의대(University of Pennsylvania Perelman School of Medicine)의 Erle Robertson 박사와 그의 연구팀은 최근 Agilent SurePrint 마이크로어레이 기술의 사용자 지정 기능 및 유연성을 활용해 SARS CoV 2 프로브를 포함하도록 PathoChip Array를 업데이트했습니다.
Pathochip은 다양한 출발 시료 유형을 사용하여 수천 개의 바이러스와 병원성 미생물로부터 DNA 및 RNA 모두를 검출할 수 있습니다. 이 마이크로어레이는 알려져 있고 공개적으로 이용 가능한 모든 바이러스 시퀀스와 수백 개의 병원성 박테리아, 곰팡이류, 효모균, 연충류에 대한 프로브를 포함하고 있습니다. 또한 새로운 유기체 및/또는 균주 검출에도 사용할 수 있습니다.
응용에 대한 유연성
본래 2016년에 개발된 UPenn Pathochip의 특별한 설계로 인해 전 세계적 요구를 해결하도록 진화할 수 있었습니다. 현재 해당 어레이는 고유 표적 물질에 대한 37,704개의 프로브 및 보존 표적 물질에 대한 23,627개의 프로브를 포함하고 있으며, 여기에는 현재의 팬데믹을 해결하기 위해 최근 추가된 19개의 SARS-CoV-2 프로브가 포함되어 있습니다. 주문형 웨비나 SARS-CoV-2에 대한 최신 병원체 검출 분석에서 Robertson 박사는 PathoChip 어레이가 어떻게 SARS-CoV-2 프로브를 포함하도록 업데이트 되었는지 그 자세한 내용을 설명합니다.
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