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Access Agilent 电子期刊(2015 年 1 月)

Agilent Bravo 平台可显著加快样品处理速度,并能提供可重现的结果

作者:Kasia Proctor
安捷伦自动化系统高级产品经理

为客户提供及时可靠分析结果的成功实验室通常面临待制备的样品数量急剧增加的问题。如果样品载量迅速增加,样品前处理步骤(如移液到孔板)将成为整个流程中的重要瓶颈。实验室已发现 Agilent Bravo 自动化液体处理平台为其成功应对样品载量的巨大飞跃提供了必要的速度和重现性。下面将通过两个客户案例说明该平台的优势。

TGen 实验室借助 Agilent Bravo 平台实现快速启动

与其同事一样,亚利桑那州斯科茨代尔市的翻译基因组学研究所助理研究员 Kristi Stephenson 迫切需要加快分析速度。位于亚利桑那州的非营利性机构 TGen 从事癌症、神经系统疾病、糖尿病、多发性骨髓瘤及其他疾病的基因组学/疾病研究。

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图 1. Kristi Stephenson 使用 Agilent Bravo 平台可重现地处理 1500 个测序样品

“它充分说明,借助 Bravo 平台,我们能够轻松开展工作并根据需要相当快速地启动。”

作为助理研究员,Stephenson 的工作是制备测序样品,这是了解复杂病症深层原因的任务中至关重要的第一步。

“在 TGen,我们希望在实验室中尽可能快速高效地完成工作,将成果转化,从而使病患获益。” Stephenson 说道。

她指出,事实上,快速推动研究发现“从实验室走向临床”是 TGen 章程的基石。

样品量以及结果重复性的巨大飞跃

Stephenson 借助 Agilent Bravo 自动化液体处理平台实现了快速启动。不到一年前,她采用手动制备样品,每次可处理 20 至 30 个样品,由于样品量少,这种方式也能完成工作,她说道。但随后,TGen 签订了一个大合同,需要处理来自 1500 名受试者的样品。

Stephenson 表示:“这是一个巨大飞跃,离开 Bravo,我们将无法完成工作。”

不可避免的过渡期很短,Bravo 平台很快启动并满负荷运行,每批可制备 96 个样品。

速度并非 TGen 唯一的考量因素,也不是 Bravo 平台唯一的优势。 Stephenson 指出,新系统在改善重现性方面尤其令人印象深刻。

她说:“该优势在用于我们完成外显子组制备时表现得尤其突出。我们获得了前所未见的高重现性结果。”

图 2. 转录组学研究机构营运经理 Yannick Lippi 赞扬 Agilent Bravo 平台实现了样品通量的显著提高

“对我们而言,Bravo 是一个优秀的平台,非常快速、精确且稳定。它不仅能够提高通量,而且还可以改善重现性。”

Bravo 平台帮助转录组学实验室满足日益增长的需求

制备待测序的样品仅仅是 Bravo 平台表现突出的领域之一。转录组学样品处理是另一个领域。转录组学(表达图谱)分析非常有用。比如,它能够告诉研究人员某种条件或治疗是否触发了受试者免疫系统的响应。

这是科学家之所以将血液和组织样品带到法国图卢兹的 GeT-TRiX 实验室进行研究的众多原因之一。他们希望了解基因处于开启状态还是关闭状态,并且想要了解受试者体内发挥作用的生物过程。

法国著名的国家农业研究院的转录组学研究机构 GeT-TRiX 可分析学术研究人员和私人实验室的样品。

该机构的营运经理 Yannick Lippi 说:“需求正在迅速增长。2011 年,即我们机构运营的第一年,分析了不到 100 个样品。而今我们每年要分析大约 1600 个样品。”

“我们解答的问题取决于样品和生物组,”Lippi 说道,“例如,某人可能带给我们来自健康受试者和糖尿病受试者的肝脏样本,他们希望了解两组之间受调控的基因以及治疗或病理所涉及的生物功能。”

更高的通量和重现性

GeT-TRiX 的 Lippi 及其同事使用 384 孔板 qPCR(定量聚合酶链反应)和安捷伦基因表达微阵列芯片处理样品。通过增加 Agilent Bravo 自动化液体处理平台,他们提高了工作效率。

“我们承担许多项目,需要处理大量样品,并且我们难以满足日益增长的需求,但采用该解决方案后,我们的通量获得显著提高,”Lippi 说道,“在使用 Bravo 之前,我们只能并行处理 48 个样品。如今,我们能够并行分析 96 个样品。”

“我们检查了通过我们的流程所获得的数据,发现它能媲美通过普遍认可的微阵列芯片流程所获得的数据以及 RNA 测序数据。”Lippi 说道。

这一全新的流程,每周可处理多达 384 个样品,意味着实验室能够满足更多的研究人员的需求,在较短的时限内为其提供准确的数据。

“对我们而言,Bravo 是一个优秀的平台,非常快速、精确且稳定,”Lippi 说道,“它不仅能够提高通量,而且还可以改善重现性。”

如果您的样品量大幅增加并且需要进行可靠、可重现地样品处理,请观看视频,了解 Agilent Bravo 自动化液体处理平台如何助您成功应对这一挑战。

在下一期的 Access Agilent 中,了解两个大学研究实验室如何使用 Bravo 平台加快其现有工作进程。

图 1.

Kristi Stephenson 使用 Agilent Bravo 平台可重现地处理 1500 个测序样品