陈士林博士
陈士林博士将多组学方法开创性地用于中药研究中。
陈博士担任中国医学科学院药用植物研究所所长,该研究所致力于确定中药中的活性成分,并从天然产物中提取新药。
陈博士和他的同事希望通过研究加深对中药抗病作用机制的理解并鉴定出相关生物标记物,以便为新药研发指明方向。
陈博士说道:“我们的团队旨在通过探索和揭示草药的基因组信息来提高对其功能和生物学的了解,为关于草药的研究提供一个高效平台。”
他指出,对用途广泛的草药进行基因组映射,有助于科学家了解其活性组分的复杂生物过程。
陈博士谈道:“这反过来又能够让我们更准确地鉴定中药真伪,进一步指导我们提高育种效率,而这两方面对于确保中药及其活性化合物的来源都非常重要。”
这个团队面临的主要挑战之一,是科学界目前尚缺乏关于草药的基础基因和代谢信息,这点与已建立模型系统的植物和农作物截然不同。
陈博士表示:“即使采用各种可用的生化研究工具,仍然很难找到关于决定代谢物合成和积累的基因线索。
通过与同事的合作,我们已经对包括灵芝 (Ganoderma lucidum) 和丹参 (Salvia miltiorrhiza) 在内的几个物种的基因组进行了测序,以此建立了研究草药基因和代谢活性的高价值模型。事实证明,这些物种可合成三萜类和二萜醌类的活性药物成分,可作为理想的模型系统。”
他表示:“我们认为安捷伦是一家顶级的企业,它为基因组学和分析化学提供了实用的创新技术、强大的试剂/消耗品和精密的仪器。我们几乎在草药基因组工作的每一阶段中都使用了安捷伦的设备。”
所用设备包括用于液体处理的自动化系统、用于定量和定性研究的创新液相色谱和质谱系统、用于新一代测序的生物分析仪以及分析生物学信息的高级软件。
据陈博士的报告内容称,他的研究正在按计划进行。
他谈道:“自 2010 年以来,我们一直尝试建立一个草药基因组学平台,以进一步研究灵芝、丹参、人参和其他草药,以作为研究草药基因和代谢活动的高价值模型。我们已经成功对 6 种草药进行了完整的基因组测序,并成功表征了一系列与药物性黄酮、二萜和三萜类成分合成相关的酶。”
此外,研究团队对人参和三七的基因组进行了相关研究,通过对野生物种和草药不同栽培品种的测序,以大量分子标记为基础,为新时代的草药育种构建了框架。
这样的结果让陈博士对中医药领域的发展抱有非常乐观的态度。
他指出:“近年来,草药基因组学的应用加速了草药研究,为中药的革新提供了前所未有的机遇。我们能够看到中药领域、尤其是草药基因组学领域的光明前景,因此我们将继续把研究重点放在这个领域。”
中国北京
中国医学科学院
药物研究所
所长
- Zhang, J.-J.; Su, H.; Zhang, L.; Liao, B.-S.; Xiao, S.-M.; Dong, L.-L.; Hu, Z.-G.; Wang, P.; Li, X.-W.; Huang, Z.-H.; Gao, Z.-M.; Zhang, L.-J.; Shen, L.; Cheng, R.-Y.; Xu, J*.; Chen, S.-L*.
Comprehensive Characterization for Ginsenosides Biosynthesis in Ginseng Root by Integration Analysis of Chemical and Transcriptome.
Molecules 2017, 22, 889. - S Chen*.; Song, J.; Sun, C.; Xu, J.; Zhu, Y.; Verpoorte, R.; Fan, T.-P.*
Herbal genomics: Examining the biology of traditional medicines.
Science 2015, 347 (6219), S27-S29. - Li, Q.; Li, Y.; Song, J.*; Xu, H.; Xu, J.; Zhu, Y.; Li, X.; Gao, H.; Dong, L.; Qian, J.; Sun, C, Shilin Chen*.
High-accuracy de novo assembly and SNP detection of chloroplast genomes using a SMRT circular consensus sequencing strategy.
New Phytologist 2014, 204 (4), 1041-1049.
仅限研究使用。不可用于诊断目的。