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Núria Canela 博士

天时地利


安捷伦科技公司帮助研究中心实施多组学方法

Núria Canela 的早期研究专注于癌症和药物研发。她从各个科学学科和分析技术中获得经验,但也很快意识到它们各自所具有的局限性。

随后,她在 2008 年进入西班牙塔拉戈纳的罗维拉-威尔吉利大学工作。

Canela 说:“我正是在那个时候萌生了创建组学科学中心的想法。这是天时地利人和促成的结果。”

该中心成立于 2013 年,其中采用了大量安捷伦仪器和软件解决方案,致力于研究系统生物学。系统生物学是基因组学、转录组学、蛋白质组学和代谢组学的组合。

“刚开始时,我重点研究的目标是将新抑制剂结合到 CDK 和细胞周期蛋白等靶标上。但后来我认为,要想取得重大进展,就需要纵观整个体系,而不仅仅是一个蛋白质。”Canela 说。

她建立的组学科学中心能够让她开展自己希望从事的工作,即拓展视野。

她说:“我们目前重点研究的是营养和健康,但秉持的观点却是应用所有可以利用的组学平台。通过连通不同科学领域的信息,我们可以得到关于所研究的生物系统更为现实的概况。此外,我们将这些知识结合成为最终的全景图,以便阐明特定表型中有哪些通路得到表达或激活。”

微生物(寄居在肠道中的多种细菌、真菌和酵母)引起了特殊关注。

“我们正在研究微生物的组成和功能对膳食改变和多种疾病,如糖尿病、代谢综合征和炎症性疾病的影响。”Canela 说道。

这是充满挑战的工作。

Canela 说:“在微生物组中,你会对许多混合在一起的微生物进行分析,因此,对每种微生物实现鉴定会十分困难。”

很多微生物甚至还没有名字。

Canela 认为:“首先必须利用元基因组学方法描述微生物群的多样性。当列出可能存在物种的列表后,你可以将这些物种的蛋白质集合在一起以构建自己的数据库。然后利用自己构建的蛋白质组数据库进行元蛋白质组学和代谢组学分析。”

这些研究的“元”性质(包括样品中的所有基因、蛋白质和代谢物)让它们充满了挑战性。

“这意味着不仅要关注单个变化,还要关注模式。”Canela 说。

也就是说,所有这些不同的分子如何发生相互作用?其中一种(或者两种、或者三种)分子的增加是否会导致其他分子的减少?这样的模式可以表明,向一个人的饮食中添加除基本营养外的新食品或成分是否会产生有益的效果,这是该中心开展研究的另一个方面。

Canela 指出该中心的主要工作内容有两项,分别是为学术界与产业界提供分析服务以及开发自己的研究项目,二者的工作量各占一半。她自豪地回忆道,就在她成立该中心一年之后,西班牙经济竞争部表彰了该中心在组学领域的研究,并将巴塞罗那的辅助基因组分析中心评为杰出的科技中心。

该中心配备了安捷伦的气相色谱仪液相色谱仪质谱仪,还有液体处理机器人生物分析仪微阵列芯片扫描仪等设备,另外还配备了整合组学数据和进行途径分析的相关软件,即 Agilent MassHunter Mass Profiler ProfessionalGeneSpring

Canela 谈道:“安捷伦作为我们重要的合作伙伴,为不同组学领域提供了解决方案,并与我们的方法完美匹配。这些系统可以帮助我们将从各种技术中得到的结果进行解析与整合,这对我们非常有用。”

她指出,该研究中心还在自行开发新的工具和新技术。

“我们主要致力于采用 GC/MS、LC/MS 和 NMR 方法对代谢物进行鉴定,”她说。“我们在研究和服务项目中都应用了这些方法。”

仅限研究使用。不可用于诊断目的。

Núria Canela 博士

西班牙塔拉戈纳
罗维拉-威尔吉利大学
组学科学中心
协调员

代表性出版物

Differential release of cell-signaling metabolites by male and female bovine embryos cultured in vitro.
Gómez E, Carrocera S, Martin D, Herrero P, Canela N, Muñoz M.
Theriogenology. 2018 Jul 1;114:180-184. doi: 10.1016/j.theriogenology.2018.03.038.

Determination of mycotoxins in plant-based beverages using QuEChERS and liquid chromatography-tandem mass spectrometry.
Miró-Abella E, Herrero P, Canela N, Arola L, Borrull F, Ras R, Fontanals N.
Food Chem. 2017 Aug 15;229:366-372. doi: 10.1016/j.foodchem.2017.02.078.

Analytical methods in sphingolipidomics: Quantitative and profiling approaches in food analysis.
Canela N, Herrero P, Mariné S, Nadal P, Ras MR, Rodríguez MÁ, Arola L.
J Chromatogr A. 2016 Jan 8;1428:16-38. doi: 10.1016/j.chroma.2015.07.110.

Metabolomics reveals impaired maturation of HDL particles in adolescents with hyperinsulinaemic androgen excess.
Samino S, Vinaixa M, Díaz M, Beltran A, Rodríguez MA, Mallol R, Heras M, Cabre A, Garcia L, Canela N, de Zegher F, Correig X, Ibáñez L, Yanes O.
Sci Rep. 2015 Jun 23;5:11496. doi: 10.1038/srep11496

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