Shilin Chen 박사
애질런트가 중국 전통 의학(TCM)을 지원합니다Shilin Chen 박사는 중국 전통 의학(TCM)에 대해 획기적인 멀티오믹스 접근을 취하고 있습니다. Chen 박사는 중국 전통 의약품 내의 유효 성분 식별과 천연물을 이용한 신약 제조에 매진하고 있는 베이징 소재 중국 의과학 연구원(Chinese Academy of Medical Sciences) 산하 약용 식물 개발 연구소(Institute of Medicinal Plant Development)를 진두지휘하고 있습니다. 그와 동료들은 한약이 질병을 분열시키는 메커니즘에 대해 깊이 이해하고 관련 바이오마커를 식별해서 신약을 발견할 수 있는 길을 제시할 수 있기를 희망합니다.
이를 이루기 위해 그들은 애질런트의 최첨단 기기와 통합 생물학 솔루션을 이용하고 있습니다.
Chen 박사는 “약초 기반 연구에 효율적인 플랫폼을 제공하기 위해 약초의 게놈 정보를 탐구하고 밝힘으로써 약초의 효능과 생명활동에 대한 이해를 증진하는 것이 우리의 목표라 할 수 있습니다”라고 말합니다. 그는 널리 사용되는 약초의 게놈 맵핑이 과학자들로 하여금 약초 내 활성 성분의 복잡한 생물학적 프로세스를 이해하도록 도와줄 것이라고 강조합니다. 또한 “이렇게 되면 중국 전통 의약품의 진위 판별을 더 정확하게 할 수 있고, 품종 개량 효율성을 향상할 수 있습니다. 이 두 가지 모두 전통 의약품과 그 활성 성분의 공급원을 확보하는 데 중요합니다.”라고 설명합니다. 연구팀의 일차적인 난관 중 하나는 현재 과학 커뮤니티에 (모델 시스템이 확립되어 있는 식물이나 작물과는 달리) 약초에 대한 기본적인 유전 정보 및 대사 관련 정보가 부족하다는 것입니다. “이용 가능한 생화학 도구를 사용해도 대사 산물 합성과 축적을 결정할 수 있는 유전자에 대한 단서를 찾는 것은 여전히 어렵습니다. “동료들과의 협력을 통해,Ganoderma lucidum(영지)와 Salvia miltiorrhiza(단삼)을 포함한 몇 가지 종(species)의 게놈 서열을 밝혀냈으며, 이것은 약초의 유전학 및 대사 활동 연구에 귀중한 모델로 부상했습니다. 이들 종은 트리테르펜류, 디테르펜 퀴논류 등의 활성 의약품 성분을 합성하는 것으로 나타나, 이상적인 모델 시스템이 되고 있습니다.”
2016년에 애질런트 Thought Leader Award를 수상한 Chen 박사는 그의 연구가 애질런트 테크놀로지스로부터 큰 도움을 받았다고 말합니다.
그는 “우리는 애질런트가 유전체학과 분석 화학 모두에 있어 실용적인 혁신과 강력한 시약/소모품 및 정밀 기기를 제공하는 최고의 기업이라는 것을 알게 되었습니다. 그리고 약초 게놈 연구의 거의 모든 단계에서 애질런트의 장비를 활용하고 있습니다.”라고 말합니다. 이러한 장비에는 액체 처리 자동화 시스템, 정량 및 정성 연구를 위한 혁신적인 액체 크로마토그래피와 질량 분석 시스템, 차세대 염기서열 분석을 위한 bioanalyzer 및 고급 생물정보학 소프트웨어가 포함됩니다. Chen 박사는 자기의 연구가 계획에 따라 진행되고 있다고 전합니다. "2010년부터,우리는 약초의 유전학 및 대사 기능을 조사하기 위한 가치있는 모델로서 Ganoderma lucidum(영지), Salvia miltiorrhiza(단삼), Panax ginseng(인삼) 및 기타 약초들을 깊이 연구하기 위해 약초 유전체학 플랫폼을 구축하려 노력해왔습니다.6개 약초의 전체 게놈 시퀀싱을 완료했고, 약제용 플라보노이드류, 디테르페노이드류 및 트리테르페노이드류 성분의 합성과 관련된 일련의 효소에 대한 특성을 규명하는 데 성공했습니다.” 또한, 연구팀의 Panax ginseng(인삼)및 Panax notoginseng(삼칠삼)에 대한 게놈 이용 연구는 야생 품종과 기타 재배 품종의 시퀀싱을 통한 대규모 분자 마커의 사용에 기반하여 약초 육종의 새로운 시대를 위한 기본 틀을 제공했습니다. 이런 결과를 통해 Chen 박사는 중국 전통 의학(TCM) 분야의 발전을 낙관적인 시선으로 바라보고 있습니다. 그는 "최근 몇 년 동안 약초 유전체학 응용은 약초 연구를 가속화했고, 전통적인 한약을 혁신할 유례 없는 기회를 제공해왔습니다. 우리는 특히 약초 유전체학과의 협력에서 전통 중국 의학(TCM)의 밝은 미래를 보고 있기에 이 분야의 연구에 계속 매진할 것입니다.”라고 말합니다.
|
Shilin Chen 박사
소장 |
선정된 발행물
Comprehensive Characterization for Ginsenosides Biosynthesis in Ginseng Root by Integration Analysis of Chemical and Transcriptome.
Herbal genomics: Examining the biology of traditional medicines.
High-accuracy de novo assembly and SNP detection of chloroplast genomes using a SMRT circular consensus sequencing strategy. |